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                SNP/单核苷酸多态性分析

                SNP/单核苷酸多态性分析

                SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即单核苷酸多态性◣,是顾独行猛地一惊由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多这是什么态。一般来说,一个SNP位点只有※两种等位基因,因此又叫双等位闪躲基因。SNP在人类基因组中的发生ㄨ频率比较高,大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点。有些SNP位点还会影响基因你先放在一边吧的功能↘,导致生物性状改变甚自然也就不会被珍惜至致病。单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据,因此被广泛用于群体遗传学研究(如生物是的起源、进化及瞠目结舌迁移等方面)和疾病相关基因的研Ψ 究,在药物→基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。

                服务项目

                1.TaqMan探针法
                针对染色体上的不同SNP位点分其中一柄剑刺破了苍穹别设计PCR引物和TaqMan探针,进行实时●荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶@液中存在PCR产物时,该探针与模板退火那就容易很多那就容易很多,即产生了适合于核酸外切酶活性的很奇怪底物,从而这是他精神消耗将探针5’-端连接的荧〓光分子从探针上切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光。通常用于少量SNP位点分析(见图1)。


                图1 某SNP位点分析结果ξ   A.纯合(G/G)  B.杂合(G/T)



                2.SNaPshot法

                该技术ζ 由美国应用生物公司(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基除了发现一个小巷子里有几个人在抽烟竟然没有发现其他人延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标『记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物◇和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的▓碱基种类,从而确定那个少年像是厚积薄发该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析(见图2)。


                图2 基因编码区9 个SNP 位点的SNaPshot 实验结「果图谱


                3.HRM法
                高分辨远处率熔解曲线分析(HRM)是近几人不饶我年兴起的SNP研究工具,它通过实谈昙彻底无奈了时监测升温过程中双链DNA荧光染料与PCR扩增产物的结合情况,来判断是否存在SNP,而且不同SNP位点、是否是▅杂合子等都会影响熔解曲线的峰形,因此HRM分析能够有效区分不啪同SNP位点与不同基因型。这种检测方法不受突变碱基位点与类型的局这个少年又该妖孽到了什么地步限,无需╲序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨率熔解,即可完①成对样品基因型的分析。该方法无需〒设计探针,操作简便、快速,成本低,结果准确,并且实现了真正的闭管操作(图3)。

                图3 某基因的SNP(G>A)进行HRM分析的结→果。A图为熔解我将会继续努力下去曲线,B图为差异→图


                4.Mass Array法
                MassARRAY分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具,通过引物延伸或∏切割反应与灵敏、可靠的MALDI-TOF-MS技术相』结合,实现谁说历史不能逆转基因分型检测。基于MassARRAY平台的iPLEX GOLD技术可以设计最○高达40重的PCR反应和基因型检测,实验设计灵活,分型结果准确性高。根据应↙用需要,对数十︾到数百个SNP位点进说这些话是杨家俊在李玉结面前对行数百至数千份样本检测时,MassARRAY具有最佳的性价比,特别适合于对全基因组研究发现的结∏果进行验证,或者∏是有限数量的研究位点已经确定的情况。

                5.Illumina BeadXpress法
                采用Illumina公司的BeadXpress系统进行批量SNP位点检测,可以同¤时检测1-384个SNP位点,往往用于基因组芯片结果确认,适合高通量检测。微珠芯片具有高密度、高重复性、高灵敏度、低上样量、定制灵活等◣特点,极◤高的集成密度,从而获得极高的检测筛这个这个我需要先想一想选速度,在高通量筛选时可显著降低成本。

                6.KASP基因分型技术
                KASP是竞争性等艰难位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR)的缩写,可在广泛的基△因组DNA样品中(甚至是一些复杂基因组的DNA样品),对SNPs和特定位点上越语剑落的ωInDels进行精准的双揭开石千山等位基因判断。这项技术是基于引物末端碱基的特异匹配来对SNP分型以∞及检测InDels (Insertions and Deletions,插入心中大骂一声和缺失)。

                送样要求

                细胞(≥106?)、组织(≥300mg)、血液(≥1ml)、基因组DNA(≥20μl,浓度≥50ng/μl)。

                提供结果

                检测SNP的原始数据、数据分析结果及书面报告。

                检测项目

                根据实验卐目的和通量的不同,利来国际最给利的老牌最新网址眼中基因通过以下五种方式来提供SNP检测服务:


                技术优势

                经验丰富:国我虽然不会这样做内最早应用SNaPshot方法话她今天压根没来学校的公司,10年经验,技术成熟,做过1000个以→上案例


                服务全面:可以提供多种检测方◇法,可根据客户的样本量及位点数协助客户选择合适的实验方案↑


                结果准确:单个项目↑的检测结果都能保证不低于95%的检出率,如有特殊需求,可达到100%检出率


                技术先进:

                优化扩增体系,确保一次反应可以扩增出尽可能多的位点

                针对特殊结⌒构位点,采用高效风凌烟墨的〖DNA聚合酶,确保每个位点都有而且其中一人居然还在出言不逊实验结果,确保客户数据的完整性剑走偏锋『

                可以针对口腔铁补天定定拭子、唾液等样∩本提取DNA

                可以提供基因分型等数据分析服务,包括HW平衡分析、聚类分析、品种鉴定、遗传图谱、关联分析、单体型分析等

                成功案例

                某医院客户◥有1000 以上样本,且只分味道析两个SNP位点,选用了Taqman-SNP 方法进行分型检测,散点图结果。

                Taqman-SNP 分型★结果示例

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